Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POP4O95707 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
POP4O95707 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
POP4O95707 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
POP4O95707 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POP4O95707 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms