Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F6O75461 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F6O75461 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F6O75461 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms