Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG13O75143 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG13O75143 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG13O75143 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG13O75143 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG13O75143 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG13O75143 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATG13O75143 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATG13O75143 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG13O75143 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG13O75143 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms