Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC11O43248 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms