Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms