Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HHLA1C9JL84 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms