Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC61Q9Y6R9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC61Q9Y6R9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms