Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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HECTD4Q9Y4D8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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HECTD4Q9Y4D8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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HECTD4Q9Y4D8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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HECTD4Q9Y4D8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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HECTD4Q9Y4D8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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HECTD4Q9Y4D8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HECTD4Q9Y4D8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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HECTD4Q9Y4D8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HECTD4Q9Y4D8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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