Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAN1Q9Y2M0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms