Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC4Q9Y296 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms