Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SETD1BQ9UPS6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SETD1BQ9UPS6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SETD1BQ9UPS6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SETD1BQ9UPS6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SETD1BQ9UPS6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SETD1BQ9UPS6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SETD1BQ9UPS6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SETD1BQ9UPS6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SETD1BQ9UPS6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SETD1BQ9UPS6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SETD1BQ9UPS6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SETD1BQ9UPS6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SETD1BQ9UPS6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms