Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX6Q9UPM6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms