Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CIZ1Q9ULV3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms