Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRXN1Q9ULB1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms