Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF346Q9UL40 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms