Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HDAC9Q9UKV0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms