Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GGA1Q9UJY5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA1Q9UJY5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms