Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIMS3Q9UJD0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms