Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DKK3Q9UBP4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DKK3Q9UBP4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms