Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms