Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms