Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GDAP2Q9NXN4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms