Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms