Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms