Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLSTN2Q9H4D0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms