Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PCGF6Q9BYE7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms