Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TREX2Q9BQ50 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms