Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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CITED1Q99966 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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CITED1Q99966 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
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CITED1Q99966 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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CITED1Q99966 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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CITED1Q99966 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CITED1Q99966 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
CITED1Q99966 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CITED1Q99966 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CITED1Q99966 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CITED1Q99966 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CITED1Q99966 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CITED1Q99966 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CITED1Q99966 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CITED1Q99966 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CITED1Q99966 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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