Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CICQ96RK0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms