Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC41A2Q96JW4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms