Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RNF185Q96GF1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms