Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP36Q96G28 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CFAP36Q96G28 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms