Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms