Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NXNL1Q96CM4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms