Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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C11orf40Q8WZ69 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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C11orf40Q8WZ69 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf40Q8WZ69 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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