Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF439Q8NDP4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF439Q8NDP4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms