Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC197Q8NCU1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms