Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLD3Q8IV08 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms