Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms