Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOA5Q6Q788 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms