Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB0

VWA1, von Willebrand factor A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA1Q6PCB0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VWA1Q6PCB0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VWA1Q6PCB0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms