Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDC42EP5Q6NZY7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms