Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCN10Q6JVE6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCN10Q6JVE6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms