Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA3Q53S33 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA3Q53S33 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA3Q53S33 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA3Q53S33 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA3Q53S33 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA3Q53S33 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA3Q53S33 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA3Q53S33 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA3Q53S33 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA3Q53S33 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BOLA3Q53S33 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA3Q53S33 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms