Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms