Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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