Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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