Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms