Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC85BQ15834 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC85BQ15834 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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