Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms